随着绍兴城市的开发性发展，经商、旅游、务工人群等庞大的人流物流活动日益频繁，使得绍兴的公共卫生管理面临着诸如疾病流行模式的变动、人口数量和结构的变化等带来的各种新挑战。在此背景下，为提升我市公共卫生管理与服务的水平，加强应对突发公共卫生事件的应急处置能力。市卫生局组织建设了以围绕应对突发公共卫生应急事件处置为核心，提供一个全过程、多层次的信息服务和多种决策辅助支持手段的应急指挥平台，平时用于业务信息管理，战时可用于应急指挥调度。
　　绍兴市公共卫生辅助决策与应急指挥系统平台，包含了疫情监测与预警系统、应急决策指挥调度系统、应急值班系统、辅助决策系统、GIS地理信息系统等等。尤其是GIS在公共卫生突发事件应急处置中的应用，大大提高了应急事件处置的交互定位能力，以明晰的空间数据表达事件发生地的地理信息情况、资源分布情况，并比对历史数据进行分析查询，为指挥中心的指挥调度工作提供了决策依据和分析手段。同时通过该系统平台可将疾病预防控制、医疗救治和卫生执法监督等体系有效连接起来，实现信息与资源共享，实施疫情控制和医疗救治工作，减轻突发公共卫生事件对居民健康和生命安全造成的威胁，用最有效的控制手段和最优的资源投入，将损失控制在最小范围。
　　目前，全市公共卫生辅助决策与应急指挥系统平台的数据中心建设在绍兴市疾病预防控制中心，硬件基础建设已经基本完成，而平台系统软件正在调试试运行阶段。